Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

053521 VU Sequenz- und Struktur-Bioinformatik (2022S)

6.00 ECTS (4.00 SWS), SPL 5 - Informatik und Wirtschaftsinformatik
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
GEMISCHT
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

First meeting/Vorbesprechung (jointly with VU Algorithmische Bioinformatik): Online meeting March 1, 10:00. Participation in the first meeting is mandatory. If subscribed, please enter the first meeting though the Moodle course. Otherwise, please enter through https://moodle.univie.ac.at/mod/bigbluebuttonbn/guestlink.php?gid=7umeQbRVKAnr

The lecture consists of three parts:

1. Structural bioinformatics (Bojan Zagrovic)
This part of the lecture is scheduled as a one-week course from Mar 28-Apr 1 (every day 9-12 and 13-17). It is identical with the first week of 301232 VO Computergestuetzte Strukturelle Biologie and 301236 UE UE zur Computergestuetzten strukturellen Biologie. It is highly recommended to also attend the second week of this VO and UE (also every day 9-12 and 13-17), which is credited separately with 3 ECTS and held from Apr 4-8.

2. Sequence bioinformatics I (Thomas Rattei)
Lectures/exercises are scheduled on 4 dates (to be fixed in the first meeting)

3. Sequence bioinformatics II (Ivo Hofacker)
Lectures/exercises are scheduled on 4 dates (to be fixed in the first meeting)

  • Dienstag 01.03. 10:00 - 12:00 Digital (Vorbesprechung)
  • Donnerstag 28.04. 14:00 - 18:15 PC-Unterrichtsraum 4, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 05.05. 14:00 - 18:15 PC-Unterrichtsraum 3, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 12.05. 14:00 - 18:15 PC-Unterrichtsraum 3, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 19.05. 14:00 - 18:15 PC-Unterrichtsraum 4, Währinger Straße 29 1.OG
  • Donnerstag 02.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 09.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 23.06. 13:15 - 18:15 Hörsaal 3, Biologie Djerassiplatz 1, 0.005, Ebene 0
  • Donnerstag 30.06. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.5, Biologie Djerassiplatz 1, 1.012, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Die Studierenden sind in der Lage, typische Fragestellungen und Methoden der Sequenz- und Strukturanalyse zu erklären und Experimente mit diesen Methoden zu planen. Die Studierenden können Sequenz- und Strukturdaten mit biologischen Datenbanken vergleichen. Die Studierenden verstehen grundlegende Methoden und Algorithmen der sequenzbasierten Vorhersagen und der Vorhersagen molekularer Strukturen. Sie können diese auf typische Probleme der Biologie und Medizin anwenden und die Resultate interpretieren.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Lösungen von Hausübungen.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Bestandene Angaben der Problemlösungen in Strukturbioinformatik, Sequenz- und Genomanalyse und RNA-Bioinformatik.

Prüfungsstoff

Strukturbioinformatik
Sequenz- und Genomanalyse
RNA-Bioinformatik

Literatur

Wird in der VU bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

Module: BIOINF03

Letzte Änderung: Do 11.05.2023 11:27