Universität Wien
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269020 VO Computational Concepts in Biology II (2021S)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 26 - Physik
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Details

Sprache: Englisch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

  • Mittwoch 10.03. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 17.03. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 24.03. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 14.04. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 21.04. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 28.04. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 05.05. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 12.05. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 19.05. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 26.05. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 02.06. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 09.06. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 16.06. 16:00 - 18:00 Digital
  • Mittwoch 23.06. 16:00 - 18:00 Digital

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Functional genomics
- Large-scale experimental methods
- Data management, reduction, normalization
- Methods for differential analysis and clustering
- Enrichment analysis and network-based analysis

Biological networks
- Topological analysis
- Stoichiometric analysis (MFA, FBA)
- Rule-based modeling of combinatorial complex networks
- Differential equation based methods
- Process algebras and model-checking

Organisms and ecosystems
- Genetics and metabolomics
- Systems biology of human diseases
- Dynamical modeling of organism development (including imaging)
- Environmental modeling (ecoenzymatic theories, stochiometry based theories)
- Information processing in biological systems

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Written exam

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Ability to explain the biological problem; ability to abstract the biological problem and to connect it to computational concepts; ability to select appropriate mathematical and computational methods; ability to perform selected computational methods and to interprete their results.

Prüfungsstoff

Lectures, seminars, practical exercises, presentations and group discussions.

Literatur

Will be provided during the lecture

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

CO-BIO2

Letzte Änderung: Fr 12.05.2023 00:22