Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

270004 UE Computer in der Biologischen Chemie (2024W)

4.00 ECTS (4.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Hier die vorlaeufige Termininfo; die offiziellen ical Eintraege folgen!

Die UE besteht aus drei unabhaengigen Abschnitten. Jeder Abschnitt besteht (1) aus Einfuehrungen und (teilweise) Nachbesprechungen. Die Teilnahme an diesen Vorlesungsteilen ist dringendst empfohlen. (2) Die praktischen Uebungen jedes Abschnitts finden mit freier Zeiteinteilung via Moodle und dem JupyterHub Server der Uni Wien, sowie weiteren von Moodle verlinkten Webservern statt.

Geplante Vorlesungseinheiten: 4./7./11.10. 2024, HS III, 13:00-16:00 (Peter Wolschann)
14./18./21./25.10.2024, HS III, 13:00-16:00 (Christoph Flamm)
28.10., 4.11. SR3, 15:30-17:00 (Stefan Boresch)

Bitte planen Sie neben den Vorlesungseinheiten Zeit fuer die praktischen Aufgaben ein, die ersten Aufgaben werden via Moodle ab dem 1.10.2024 abrufbar sein. Die LVA sollte Mitte November (inkl. Abgabe aller Protokolle) beendet sein.

  • Freitag 04.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Montag 07.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Freitag 11.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Montag 14.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Freitag 18.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Montag 21.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Freitag 25.10. 13:00 - 16:00 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Montag 28.10. 15:30 - 17:00 Seminarraum 3 Organische Chemie 1OG Boltzmanngasse 1
  • Montag 04.11. 15:30 - 17:00 Seminarraum 3 Organische Chemie 1OG Boltzmanngasse 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

1) Kennenlernen von einfacher Molecular Modeling Software, Datenbanksuche von Proteinstrukturen (Pdb), sowie Verwendung ergaenzender Auswertungsprogramme, Arbeiten mit Protein - Modeling Software sowie mit interaktiven Servern. Berechnung von Pharmacophoren und Screenen von Wirkstoffdatenbanken.

2) Einfuhrung in Kraftfeldrechnungen. Basis der Kraftfeldterme, Grundlagen von Minimierung und Molekulardynamik. Aufsetzen einer Simulation mit interaktiven Servern.

3) Einführung in Computermethoden zur Untersuchung der Struktur und Dynamik von Reaktionsnetzwerken die aus kleiner organischer Moleküle aufgebaut werden.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Fortlaufende Beurteilung der Mitarbeit / Protokolle

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vollständiges Durcharbeiten der drei Teile. Die Gesamtnote setzt sich aus der Beurteilung der drei Einzelteile zusammen (arithmetisches Mittel).

Prüfungsstoff

Praktische Arbeit mit diversen Programmen

Literatur

Materialien / Unterlagen werden von den Vortragenden zur Verfuegung gestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BC-DAT I-1

Letzte Änderung: Di 17.09.2024 15:06