Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.
270037 UE Übungen zu Computergrafik und Molekulare Modellierung (2018W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Labels
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Sa 01.09.2018 08:00 bis Mi 31.10.2018 12:00
- Abmeldung bis Mi 31.10.2018 12:00
Details
max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lehrende
Termine
08.01. - 24.1.2019
15:00 - 18:00
Ort wird noch bekannt gegeben.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Beurteilung: Beobachtung der Mitarbeit sowie Beurteilung des abzugebenden Protokolls
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Die Studenten können selbständig Molekülgrafikprogramme verwenden um Informationen über ein bestimmtes Protein zu visualisieren bzw. Unterschiede zwischen verwandten Proteinstrukturen zu
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
erforschen. Es werden Grundkonzepte von Molekularmechanikrechnungen vermittelt, die zur Ergänzung der strukturbasierten Methoden verwendet
werden.
Prüfungsstoff
Praktisches Arbeiten am Computer
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
TC-3, M205, M206, CHE II-6, CHE II-7
Letzte Änderung: Mo 08.10.2018 13:28
Einführung in die Verwendung von Molekülgrafikprogrammen, dzt. primaer VMD. Vergleich von NMR und X-Ray Struktur desselben Biomoleküls.
Quantifizierung von Unterschieden (RMSD, Secondary Structure Assignment, Netzwerk von Wasserstoffbrücken...). Einführung in die weiterführenden Funktionen von VMD. Erzeugen "schöner" Darstellungen und Movies. Kurze Einführung in Molekularmechanikrechnungen (CHARMM). Ein Schwerpunkt dabei liegt im korrekten Aufsetzen
des Systems (Ergaenzen fehlender Koordinaten, Protonierungszustand von Seitenketten des Proteins bzw. des Liganden).Lernbehelfe: Schriftliche Unterlagen werden zur Verfügung gestellt (zum Grossteil in Englisch!)