270146 UE Theoretisch-chemische Übungen (2012S)

Die Übungen orientieren sich an der Vorlesung "Theoretische Chemie" bei Prof. Steinhauser. Zunächst wird der Harmonische Oszillator klassisch und quantenmechanisch thematisiert. Ausgehend von der Schrödingergleichung werden hier aus oszillierende Wellenpakete untersucht. Die chemische Bindung wird mit Hilfe der Molekülorbitaltheorie untersucht und abschliessend einfache Hartree-Fock (bzw. Roothaan-Hall) Rechnungen durchgeführt. Als abschliessendes quantenmechanisches Beispiel dient die SN2-Reaktion von Methylchlorid mit Chlorid. Im molekulardynamischen Teil werden die Grundlagen der Molekulardynamik erläutert. Die empirischen Potentialfunktionen, die den molekulardynamischen Kraftfeld zugrunde liegen, werden vorgestellt. In MATHEMATICA sollen die Kenntnisse dieser Potentialfunktionen vertieft werden. Ziel ist die Bewertung und Optimierung von Molekülgeometrien und die Visualisierung grösserer Oligopeptide und Proteinsegmente. Dazu werden kurze Trajektorien in CHARMM produziert und interpretiert.