Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

270151 VU Computational Systems Biology: from enzymes to networks (2021W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT
Moodle

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Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Mo bis Fr von 16 bis 18.30 Uhr außer am Mi, wo wir eine Stunde später starten, dh. 17 bis 19.30 Uhr. Speziell,
18.,19., 21., 22 Oktober, 16-18:30 Uhr + 22. Oktober, 17-19:30 Uhr
8., 9., 11., 12. November, 16-18:30 Uhr + 10. November, 17-19:30 Uhr
Vor Ort.

  • Montag 18.10. 16:00 - 18:00 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Dienstag 19.10. 16:00 - 18:00 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Mittwoch 20.10. 17:00 - 19:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Donnerstag 21.10. 16:00 - 18:00 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Freitag 22.10. 16:00 - 18:00 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Montag 08.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Dienstag 09.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Mittwoch 10.11. 17:00 - 19:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Donnerstag 11.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Freitag 12.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

Computer models of biochemical networks are able to connect the genotype with the phenotype. In this primer we will give an introduction to biochemical network analysis. We will introduce basic concepts of network reconstruction, kinetic modelling and constraint based analysis of biological networks. In addition you will get a brief introduction to COPASI and cobrapy to carry simple computational analyses.

(*) Grundlegende mathematische Konzepte in der Systembiologie
(*) Rekonstruktion von (biologischen) Netzwerken
(*) Stöchiometrische Netzwerke und ihre Analyse
(*) Anwendungen in der Biotechnologie

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Verwenden metabolische Modelle zur Stammoptimierung
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Prüfung (75%) + kleines Forschungsprojekt (25%) + Hausübung (Bonuspunkte, 4% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vorwissen in Linearer Algebra ist vorteilhaft und sehr hilfreich aber nicht notwendig.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, BC-1, CHE II-1

Letzte Änderung: Mi 20.10.2021 15:09