Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

270151 VU Computational Systems Biology: from enzymes to networks (2022W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

17.10.-21.10. von 16:00-18:30 im Hörsaal 1
21.11. von 16:00-18:30 im Hörsaal 3
22.11. von 15:30-18:00 im Hörsaal 3
23.11. von 16:30-19:00 im Seminarraum 2
24.11. von 16:00-18:30 im Seminarraum 2
25.11. von 16:00-18:30 im Hörsaal 3

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch

Lehrende

Termine

17.10.-21.10. von 16:00-18:30 im Hörsaal 1
21.11. von 16:00-18:30 im Hörsaal 3
22.11. von 15:30-18:00 im Hörsaal 3
23.11. von 16:30-19:00 im Seminarraum 2
24.11. von 16:00-18:30 im Seminarraum 2
25.11. von 16:00-18:30 im Hörsaal 3


Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

Computer models of biochemical networks are able to connect the genotype with the phenotype. In this primer we will give an introduction to biochemical network analysis. We will introduce basic concepts of network reconstruction, kinetic modelling and constraint based analysis of biological networks. In addition you will get a brief introduction to COPASI and cobrapy to carry simple computational analyses.

(*) Grundlegende mathematische Konzepte in der Systembiologie
(*) Rekonstruktion von (biologischen) Netzwerken
(*) Stöchiometrische Netzwerke und ihre Analyse
(*) Anwendungen in der Biotechnologie

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Verwenden metabolische Modelle zur Stammoptimierung
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Prüfung (75%) + kleines Forschungsprojekt (25%) + Hausübung (Bonuspunkte, 4% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Vorwissen in Linearer Algebra ist vorteilhaft und sehr hilfreich aber nicht notwendig.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur


Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, BC-1, CHE II-1, BC-3, CH-CBS-05, BC-CHE II-8, Design

Letzte Änderung: Mo 03.10.2022 14:09