Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

270151 VU Computational Systems Biology: from enzymes to networks (2023W)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 27 - Chemie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

  • Montag 16.10. 16:00 - 18:30 Kleiner Hörsaal 3 Chemie Boltzmanngasse 1 HP
  • Dienstag 17.10. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
  • Mittwoch 18.10. 16:00 - 18:30 Seminarraum 3 Organische Chemie 1OG Boltzmanngasse 1
  • Donnerstag 19.10. 16:00 - 18:30 Seminarraum 1 Analytische Chemie 2.OG Boltzmanngasse 1
  • Freitag 20.10. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
  • Montag 20.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
  • Dienstag 21.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
  • Mittwoch 22.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 2 Währinger Straße 38 Dekanat 1. Stock
  • Donnerstag 23.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42
  • Freitag 24.11. 16:00 - 18:30 Seminarraum 4 Institut Physikalische Chemie HP Währinger Straße 42

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

*Diese LV findet auf Englisch statt*

This course will introduce basic concepts in systems biology and mathematical modelling. It will cover network reconstruction, kinetic modelling and constraint-based analysis of biological networks. In addition, you will get an introduction to COPASI to carry out simple computational analyses of various systems (metabolic networks, epidemiological models, signalling networks, gene expression...).

Ziele: Studierende
(*) Verstehen die Grundprobleme in der mathematischen Modellierung
(*) Kennen wichtige mathematische Modelltypen
(*) Sind in der Lage einfache Reaktionsnetzwerke aufzusetzen
(*) Simulationen in Copasi durchführen
(*) Kennen verschiede Datenbanken, die hilfreich für metabolische Analysen sind

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Schriftliche Prüfung (50%) + kleines Forschungsprojekt (35%) + Hausübung (insgesamt 15%, 5% pro Hausübung)

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Grundlegende Kenntnisse der Biologie
Ein gewisses Verständnis für Differentialgleichungen ist hilfreich, aber nicht notwendig

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesung

Literatur

Slides and related scientific publications will be provided during the course

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

AN-2, BC-1, CHE II-1, BC-3, CH-CBS-05, BC-CHE II-8, Design

Letzte Änderung: Mi 22.11.2023 15:28