Universität Wien
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300045 VO Bioinformatik für die Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome (2024S)

4.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie

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Details

Sprache: Deutsch

Prüfungstermine

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

  • Mittwoch 06.03. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 13.03. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 20.03. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 10.04. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 17.04. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 24.04. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 08.05. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 15.05. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 22.05. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 29.05. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 05.06. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 12.06. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1
  • Mittwoch 19.06. 11:30 - 14:00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Diese Vorlesung gibt einen Überblick über Methoden der Bioinformatik zur Analyse mikrobieller Genome, Metagenome und Metatranskriptome. Es werden sowohl etablierte Methoden und Werkzeuge, z.B. zur Genvorhersage oder zur funktionellen und strukturellen Klassikation von Proteinen, als auch neu entwickelte Methoden, z.B. zur Funktionszuordnung durch genomische Assoziationen, erläutert und diskutiert. Praktische Übungen demonstrieren den Einsatz ausgewählter Bioinformatik-Programme für typische Problemstellungen.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Termine der schriftlichen Abschlussklausuren (open-book: alle schriftlichen/gedruckten Hilfsmittel dürfen verwendet werden):
26.6. 2024 11.30-13.00 Seminarraum 1.7, Biologie Djerassiplatz 1, 1.010, Ebene 1 1.010
Oktober 2024, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Dezember 2024, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA
Januar 2025, Biologie Djerassiplatz 1, Datum und Raum TBA

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verstehen typischer Problemstellungen der mikrobiellen Genomik, Metagenomik und Metatranskriptomik. Anwendung bioinformatischer Methoden zur Lösung dieser Probleme und Interpretation der Ergebnisse im biologischen Kontext.

Beurteilungsmaßstab der schriftlichen Klausur:
<50%: 5
<62.5%: 4
<75%: 3
<87.5%: 2
>=87.5%: 1

Prüfungsstoff

Vortrag und Erörterung/Diskussion von ausgewählten Themen. Unterrichtssprache Deutsch, mit englischsprachigen Materialien. Haus-Übungen.

Literatur

Wird in der Lehrveranstaltung auf der elearning Plattform bereitgestellt.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BOE 9

Letzte Änderung: Di 25.06.2024 07:26