Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.
300048 UE Sequencing bioinformatics for beginners (2024S)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 08.02.2024 14:00 bis Do 22.02.2024 18:00
- Abmeldung bis Fr 15.03.2024 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
- Dienstag 05.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 19.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 09.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 16.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 23.04. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Donnerstag 02.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Freitag 10.05. 09:45 - 11:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 14.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 21.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 28.05. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 04.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 11.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 18.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
- Dienstag 25.06. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Aktive Mitarbeit. Lösen von 4 Aufgaben im Kurs (unter Anleitung).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Einreichen der Lösungsvorschläge für 4 Aufgaben durch Moodle. Bewertet wird zuerst das grundlegende Verständnis der Lösungsansätze, dann die Richtigkeit der Lösung. Jede Aufgabe repräsentiert 25% der Note.
Prüfungsstoff
Application of bash commands introduced in the course; application of mapping, genotyping & filtering tools.
Literatur
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
BAN 5
Letzte Änderung: Mi 31.07.2024 12:06
Wie benutzt man die Command line? Wie arbeitet man mit bash und integrierten Programmen, und nutzt R zu Analyse und Visualisierung? Wie arbeitet man mit großen Dateien, insbesondere durch DNA-Sequenzierung? Welche Dateitypen gibt es in diesem Zusammenhang? Wie benutzt man Referenzgenome, wie werden Sequenzierdaten gemappt und gefiltert? Wie kommt man zu Genotypen, wie prozessiert man diese?