Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.
300058 SE Bioinformatik für Metagenomik und Metatranskriptomik (2011W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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Vorbesprechung am 12.1.2012 - 16 Uhr im Besprechungsraum Ökologie, UZA I, Raum 2.255Die LV findet vom 6. bis incl. 10.Feber 2012 ( 9-17 Uhr ) im Computerraum statt !
An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 01.09.2011 08:00 bis Mi 21.09.2011 20:00
- Abmeldung bis So 30.10.2011 23:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine
Zur Zeit sind keine Termine bekannt.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
With the breakthrough of next generation DNA sequencing methods and their application to environmental samples, metagenomic and metatranscriptomic sequences have indelibly expanded the known DNA and protein sequence space to non-culturable micro-organisms and environmental communities. This practical seminar introduces the major computational methods necessary to process, analyse and interpret these sequences.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Report (to be written in workgroups).
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Participants learn in this practical seminar how to pre-process environmental sequences (i.e. estimation and correction of sequencing errors), how to estimate taxonomic diversity in metagenomic and metatranscriptomic samples and how to investigate the function and taxonomy of environmental sequences.
Prüfungsstoff
This practical seminar will consist of theoretical (lecture like) introductions to the topics, discussion of selected scientific papers and practical exercises in the computer room.
Literatur
Will be provided during the seminar.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MOE W-5, MMB W-2, MMB W-3, MMI III-1
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43