300224 PP Genomanalyse von Prokaryoten (2015S)
Angewandte Bioinformatik zur Analyse eines Genomsequenz
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 05.02.2015 08:00 bis Do 19.02.2015 18:00
- Abmeldung bis Fr 27.03.2015 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch, Englisch
Lehrende
Termine
Vorbesprechung am Mittwoch, 3.6.2015 um 16 Uhr im Seminarraum 2.257, UZA I (CUBE), Ebene 2, Spange 4. Die Teilnahme an der Vorbesprechung ist für alle TeilnehmerInnen verpflichtend, Praktikum vom 6.7. bis 17.7.2015, von 9-17 Uhr im Seminarraum 2D404, UZA2, Althanstrasse 14.
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
Dieses Projektpraktikum vermittelt die Kenntnisse und Fähigkeiten, die für die Annotation und Analyse prokaryotischer Genome erforderlich sind. Dies umfasst u.a. Genvorhersage, Proteinfunktions- und -strukturvorhersage und vergleichende Genomanalysen. Die Analyse aktueller, noch unpublizierter Genomsequenzen mit diesen Bioinformatik-Methoden erlaubt es in diesem Praktikum, aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen aus der Mikrobiologie und mikrobiellen Ökologie realitätsnah zu bearbeiten. Grundkenntnisse in der Bioinformatik und Genomik (z.B. wie in der Vorlesung 300311 vermittelt) sind für diese LV erforderlich.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Schriftlicher Bericht im Publikationsformat.
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
Verstehen und Anwenden wesentlicher Bioinformatik-Methoden der Genomanalyse; Automatisieren umfangreicher Analysen mitteln kleiner selbstgeschriebener Skripte; Interpretation der Ergebnisse umfangreicher Bioinformatik-Analysen im Hinblick auf den zugrunde liegenden Organismus.
Prüfungsstoff
Diverse Bioinformatik-Methoden zur Genomanalyse, Programmiersprache Perl.
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).
Arbeit in kleinen Arbeitsgruppen (jede Gruppe bearbeitet ein anderes Genom).
Literatur
Wird im Seminar bereitgestellt.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
B-BOE 12, B-BOE 13, B-BMB 11B, B-BMG 12B
Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43