Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.
300224 SE Bioinformatics for Microbial Metagenomics (2020W)
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
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An/Abmeldung
Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
- Anmeldung von Do 10.09.2020 08:00 bis Do 24.09.2020 18:00
- Abmeldung bis Sa 31.10.2020 18:00
Details
max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lehrende
Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert
- Donnerstag 19.11. 13:00 - 17:00 Digital
- Montag 23.11. 13:00 - 17:00 Digital
- Donnerstag 26.11. 13:00 - 17:00 Digital
- Montag 30.11. 13:00 - 17:00 Digital
- Donnerstag 03.12. 13:00 - 17:00 Digital
- Montag 07.12. 13:00 - 17:00 Digital
- Donnerstag 10.12. 13:00 - 17:00 Digital
- Montag 14.12. 13:00 - 17:00 Digital
Information
Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung
This course will focus on bioinformatic approaches in metagenomics for the analysis of mixed microbial communities (microbiomes). The aim of the course is to provide the student with the ability to perform metagenomic analyses and importantly be able to interpret these analyses in the wider biological context. Topics that will be covered include community profiling, genome reconstruction from mixed samples, comparative genomics, exploring the uncharacterised hidden microbial diversity in samples and phylogenetics. The course will offer practical exercises as well as a group project to support the lectures and discussions in class.
Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel
Assessment will be based on a group project and overall examination.
Participants must achieve at least 50 pts. by the end of the course.
Grading:
< 50.0: 5
< 62.5: 4
< 75.0: 3
< 87.5: 2
else: 1
Participants must achieve at least 50 pts. by the end of the course.
Grading:
< 50.0: 5
< 62.5: 4
< 75.0: 3
< 87.5: 2
else: 1
Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab
There are no strict minimum requirements. But students should have experience in Unix/Linux. A basic understanding of Microbiology is recommended and knowledge of microbial genomics would be advantageous, it is therefore a recommendation students have previously completed course 301060 Practical course on bioinformatics of microbial genomes and metagenomes
Prüfungsstoff
Presentation of group project and examination of content presented in the course.
Literatur
Will be provided during the lecture on the elearning platform.
Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis
MMB W-2, MMB W-3, MMEI II-1.2, MMEI II-2.2
Letzte Änderung: Fr 12.05.2023 00:23