Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300319 UE Plant Chromosome Structure and Evolution: theory and practice (2013W)

Chromosome analysis in flowering plants

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

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Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 10 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

  • Dienstag 08.10. 13:00 - 13:30 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 15.10. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 22.10. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 29.10. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 05.11. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 12.11. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 19.11. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 26.11. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 03.12. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG
  • Dienstag 10.12. 13:00 - 15:00 Übungsraum 3 (Fakultätszentrum für Biodiversität) Rennweg 1.OG

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Coursework (written) 60%
Active participation in experiment planning and results analyses 20%
Written report (in form of manuscript) 20%

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

- To introduce modern techniques used nowadays to study the structuure and function of plant genomes and to emphasize the importance of such analyses as complementary approach for phylogenetic, evolutionary, or populational studies.

- To introduce methods for in situ-hybridization probe preparation and labelling, chromosome preparation and quality checks, and finally in situ hybridization

Students can further apply this knowledge to analyse and to interpret obtained results (microscopy).

Prüfungsstoff

- Lectures
- Planning of the experiments; material pre-treatment and fixation; preparation of chromosome spreads using classical methods; documentation.
- Enzymatic chromosome preparations; DNA probe preparation and labelling (PCR labelling, nick translation); preparation of buffers and solutions for FISH.
- Checking of the quality of DNA probe labelling; FISH (fluorescent in situ hybridization); pretreatments, and hybridization.
- FISH: washing, detection and amplification.
- Analysis of FISH data (microscopy)

Literatur

Maluszynska J. (ed.) 1998. Plant cytogenetics. Silesian University, Katowice, Poland.
Fukui K., and Nakamya S. (1996). Plant chromosomes. Laboratory methods. CRC Press, Boca Raton.
Weiss-Schneeweiss H., and Schneeweiss G.M. 2012. Karyotype Evolution in Angiosperms. Springer
Levin D. A. (2002) The role of chromosomal change in plant evolution. Oxford University Press, New York, USA.
Puertas M.J. & Naranjo T. (eds.) 2005. Plant cytogenetics. Karger, Basel.
Schwarzacher T., and Heslop-Harrison P. (2000) Practical in situ hybridization. 2nd ed. BIOS, Oxford UK.
Singh R.J. (2003) Plant cytogenetics. CRC Press, Boca Raton.
Stebbins G. L. (1971) Chromosomal evolution in higher plants. Edward Arnold, London.
Puertas M.J. & Naranjo T. (eds.) 2008. Plant cytogenetics. Karger, Basel.
Birchler J. & Pires C. (eds) 2010. Advances in Plant Cytogenetics. Karger, Basel.
Plant Genome Diversity (book; 2 volumes; 2012 and 2013; Springer)

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MBO 5, MPF II- 2 ,MEV W-6, MGE III-2

Letzte Änderung: Mo 07.09.2020 15:43