Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300362 UE Applied Data Analysis (2020S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung/Preliminary meeting:
25.03.2020 um/at 13:30 Uhr im/in COSB Seminarraum
(Biozentrum Althanstraße 14, 1090 Wien)
The course is planned for 10 days total over the course of 4 weeks of half-day lecturing and supervised project work/discussion beginning around April 20th till mid May.

  • Mittwoch 25.03. 13:30 - 14:30 COSB-Seminarraum
  • Montag 20.04. 09:00 - 17:00 COSB-Seminarraum
  • Dienstag 21.04. 09:00 - 12:00 Konferenzraum
  • Dienstag 21.04. 12:00 - 17:00 Übungsraum 2
  • Montag 27.04. 09:00 - 17:00 COSB-Seminarraum
  • Dienstag 28.04. 09:00 - 12:00 Konferenzraum
  • Dienstag 28.04. 12:00 - 17:00 Übungsraum 2
  • Donnerstag 30.04. 09:00 - 17:00 Übungsraum 2
  • Montag 04.05. 09:00 - 17:00 COSB-Seminarraum
  • Donnerstag 07.05. 09:00 - 17:00 Übungsraum 2
  • Montag 11.05. 09:00 - 17:00 COSB-Seminarraum
  • Dienstag 12.05. 09:00 - 12:00 Konferenzraum
  • Dienstag 12.05. 12:00 - 17:00 Übungsraum 2
  • Donnerstag 14.05. 09:00 - 17:00 Übungsraum 2

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

In this course we will learn about modern high-throughput methodologies and get hands-on experience with new methods and real data. We will discuss sequencing technology, experiment design, quality control, read mapping and counting, differential expression analysis, expression profiles and principal components analysis.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Exercises will be done throughout the course as a part of a collective analysis.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.
There are 10 days of the course. Presence on at least 8 days is required. The grade will be based on course participation (20%) and the final report in a form of a scientific paper outlining the aims and analyses completed during the course, as well as potential future directions (80%).

Prüfungsstoff

A final report describing the methods used as well as an analysis of the data will be required after completion of the course. Attendance and participation are also graded.

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MES6, MMEI III, MGE III-2, MMB W-2, MMB W-3, M-WZB

Letzte Änderung: Sa 22.10.2022 00:30