Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

300362 UE Applied Data Analysis (2024S)

10.00 ECTS (6.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Initial meeting on March 18th at 3pm at UBB (SR1.3).

  • Montag 18.03. 15:00 - 16:30 Seminarraum 1.3, Biologie Djerassiplatz 1, 1.005, Ebene 1 (Vorbesprechung)
  • Montag 22.04. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.3, Biologie Djerassiplatz 1, 1.005, Ebene 1
  • Mittwoch 24.04. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Donnerstag 25.04. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Montag 29.04. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.3, Biologie Djerassiplatz 1, 1.005, Ebene 1
  • Dienstag 30.04. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Freitag 03.05. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Montag 06.05. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.3, Biologie Djerassiplatz 1, 1.005, Ebene 1
  • Dienstag 07.05. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Montag 13.05. 08:00 - 18:15 Seminarraum 1.3, Biologie Djerassiplatz 1, 1.005, Ebene 1
  • Dienstag 14.05. 08:00 - 13:00 Seminarraum 1.8, Biologie Djerassiplatz 1, 1.007, Ebene 1
  • Dienstag 14.05. 13:15 - 18:15 Seminarraum 1.2, Biologie Djerassiplatz 1, 1.004, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

In this course we will learn about modern high-throughput methodologies and get hands-on experience with new methods and real data. We will discuss sequencing technology, experiment design, quality control, assembly, read mapping and counting, differential expression analysis, expression profiles and principal components analysis.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Exercises will be done throughout the course as a part of a collective analysis.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

There are 10 days of the course. Presence on at least 8 days is required. The grade will be based on course participation (20%) and the final report in a form of a scientific paper outlining the aims and analyses completed during the course, as well as potential future directions (80%).
Students are recommended but not required to take 300353 UE Applied programming for Bioinformatics, or have a basic grounding in Unix and BASH shell scripting.

Prüfungsstoff

A final report describing the methods used as well as an analysis of the data will be required after completion of the course. Attendance and participation are also graded.

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MES6, MMEI III, MGE III-2, MMB W-2, MMB W-3, M-WZB, MMB IV., MNEU V.

Letzte Änderung: Mi 31.07.2024 12:06