Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301080 VU Bioinformatik für Biologen (2024S)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 80 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

BITTE BEACHTEN:
- Die erste Einheit am 7.3. incl. Vorbesprechung und der ersten Vorlesungseinheit findet ONLINE statt. Der Link zur online Session wird über die Moodle-Seite bereit gestellt.
- Die beiden Tests finden statt am Freitag, den 26.4.2024, und Freitag, den 28.62024 - am späteren Nachmittag (die exakte Zeit wird im Kurs bekannt gegeben).

  • Donnerstag 07.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 14.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 21.03. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 11.04. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 18.04. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 25.04. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 02.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 23.05. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 06.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 13.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 20.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
  • Donnerstag 27.06. 10:00 - 13:00 STB/Hörsaal A Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien
    STB/Hörsaal B Campus Vienna Biocenter 5, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

a. Ziele: Verständnis der grundlegenden Konzepte und Methoden der Bioinformatik;
b. Inhalte: Die Lehrveranstaltung gibt einen breiten Überblick über Methoden und Anwendungen aus den Bioinformatik Bereichen exaktes String-Matching, paarweises Sequenzalignment, multiples Sequenzalignment, Sequenzdatenbanksuche, Wahrscheinlichkeiten auf Sequenzen, hidden Markov Modelle (HMMs), Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, Hochdurchsatz-Sequenzierverfahren, Genomassemblierung, Read-Mapping und Genomanalyse;
c. Methoden: Vorlesung, 4 bewertete Hausübungen (Moodle), Hausübungs-Besprechungen, ergänzende Hausübungen (zur Testvorbereitung, nicht bewertet), 2 schriftliche Tests
HINWEIS: Die Vorbesprechung (Platzvergabe) und Vorlesung am ersten Termin werden online abgehalten werden.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

a. Art der Leistungskontrolle: Im Laufe der VU sind folgende Leistungsüberprüfungen zu absolvieren: 2 schriftliche Tests (Multiple Choice und offene Fragen), die jeweils 30% zählen und jeweils etwa die Hälfte der Lehrstoffs abdecken. So wie 4 Hausübungen, deren Lösungen einzureichen sind und jeweils 10% zählen.
b. Erlaubte Hilfsmittel: Während der Tests sind keine Hilfsmittel erlaubt (auch keine Handys, Smartphones, Taschenrechner, etc).

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

a. Mindestanforderung: Anwesenheit in der Vorbesprechung am ersten Tag (mglw. online). Anwesenheit während des Kurses (diese wird im Rahmen der Tests und Übungsbesprechungen überprüft). Zum Bestehen müssen mindestens 50% der möglichen gewichteten Gesamtpunktzahl erreicht werden. Der tatsächlich erreichte Prozentsatz bestimmt die Note.
b. Beurteilungsmaßstab: Die folgenden erreichten Prozentzahlen entsprechen den folgenden Noten:
>=87.5%: Note 1 (sehr gut)
<87.5%: Note 2 (gut)
<75.0%: Note 3 (befriedigend)
<62.5%: Note 4 (genügend)
<50.0%: Note 5 (nicht genügend)

Prüfungsstoff

Prüfungsrelevant sind alle in der Lehrveranstaltung, den Vorlesungen, den Handouts, den Hausübungen (bewertet und ergänzend) und den Übungsbesprechungen vorkommenden Inhalte.

Literatur

Ein Liste möglicher Literatur wird in der ersten Vorlesungseinheit bekannt gegeben. Zusätzliche Referenzen gibt es im Laufe der Vorlesungen.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Do 22.02.2024 14:46