Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301151 UE UE in Fluoreszenz und Konfokalmikroskopie inkl.Übungen zur Bild-bearbeitung/analyse (2022W)

für Diplomanden, Dissertanden und fortgeschrittene Studenten

3.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

Zusammenfassung

1 Gotzmann , Moodle
2 Gotzmann , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 8 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine

UNTERRICHTSSPRACHE IST ENGLISCH!!!

VORBESPRECHUNG (DIGITAL VIA ZOOM): Mi, 12.10. 10h00

Josef Gotzmann is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
Topic: Preliminary Meeting Confocal Course WS22-23
Time: Oct 12, 2022 10:00 AM Vienna
Join Zoom Meeting
https://univienna.zoom.us/j/63096703978?pwd=a1FmRFlrdEhGZmZpZEVEWUVGcTMrUT09
Meeting ID: 630 9670 3978
Passcode: 322921

Details zum Kurs in Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=328477

Die Anmeldung über U:Space für EINEN der beiden angebotenen Kurse (301151-1 oder-2) ist ausreichend!!

Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!

Im Falle einer Überbuchung behält sich der Kursleiter das Recht vor, basierend auf dem Karrierestatus und der Notwendigkeit des Kursinhalts (z.B. für laufende Master/PhD-Arbeiten) die Teilnehmer zu selektieren.

Beschränkte Teilnehmerzahl: 8 (pro Kurs; insgesamt 16)

Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.

Dato (Juni 2022) gehen wir davon aus, daß der gesamte Kurs in Präsenz abgehalten werden kann. Änderungen werden zeitnah bekanntgegeben!

Termin(e): Abhaltungstermine für BEIDE Kurse : 15.-17.11; 22.+23.11; 29.+30.11.; 5.+6.12.
Anwesenheit an all diesen Tagen wird gefordert.

Ort: MPL-VBC5, Ebene E1, Dr. Bohrg. 9, 1030 Wien.

Gruppe 2

max. 8 Teilnehmer*innen
Sprache: Deutsch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine

UNTERRICHTSSPRACHE IST ENGLISCH!!!

VORBESPRECHUNG (DIGITAL VIA ZOOM): Mi, 12.10. 10h00

Josef Gotzmann is inviting you to a scheduled Zoom meeting.
Topic: Preliminary Meeting Confocal Course WS22-23
Time: Oct 12, 2022 10:00 AM Vienna
Join Zoom Meeting
https://univienna.zoom.us/j/63096703978?pwd=a1FmRFlrdEhGZmZpZEVEWUVGcTMrUT09
Meeting ID: 630 9670 3978
Passcode: 322921

Details zum Kurs in Moodle: https://moodle.univie.ac.at/course/view.php?id=328477

Die Anmeldung über U:Space für EINEN der beiden angebotenen Kurse (301151-1 oder-2) ist ausreichend!!

Die Anmeldung über U:Space bedingt NICHT zwingend auch eine Teilnahmeberechtigung!

Im Falle einer Überbuchung behält sich der Kursleiter das Recht vor, basierend auf dem Karrierestatus und der Notwendigkeit des Kursinhalts (z.B. für laufende Master/PhD-Arbeiten) die Teilnehmer zu selektieren.

Beschränkte Teilnehmerzahl: 8 (pro Kurs; insgesamt 16)

Details zu Programm und Ablauf in Vorbesprechung.

Dato (Juni 2022) gehen wir davon aus, daß der gesamte Kurs in Präsenz abgehalten werden kann. Änderungen werden zeitnah bekanntgegeben!

Termin(e): Abhaltungstermine für BEIDE Kurse : 15.-17.11; 22.+23.11; 29.+30.11.; 5.+6.12.
Anwesenheit an all diesen Tagen wird gefordert.

Ort: MPL-VBC5, Ebene E1, Dr. Bohrg. 9, 1030 Wien.

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Theoretische Grundlagen der Fluoreszenz- und Konfokalmikroskopie.

Technische Erläuterung und Training an den verwendeten Geräten

Laborübungen Probenvorbereitungen
Qualitätskriterien und Aberrationskorrekturen

SELBSTÄNDIGES Mikroskopieren von ausgewählten Proben mittels Konfokalmikroskopie (Mehrkanalaufnahmen, serielle optische Schnitte durch Proben, Bildprojektionen, Aufnehmen von Zeitserien)

2 volle Arbeitstage: Bildanalyse und Dekonvolution von eigens angefertigten Bildern, Einführung in Image J

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Verpflichtende Anwesenheit. Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Ergebnis der Versuche, laufend Kontrolle des theoretischen Wissens (50%/20%/30%). Jede der Teilleistungen muss positiv sein.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Ziel des Kurses ist es theoretische und praktische Unterstützung für Studierende zu vermitteln, die bereits oder in naher Zukunft lichtmikroskopische Experimente durchführen (zB im Rahmen von Master/PhD/PostDoc-Arbeiten). Die gewählte Gruppengröße (2 Personen) ermöglicht ein äußert effizientes Arbeiten in einem "Privatissimum"-ähnlichen Setting.

Prüfungsstoff

Probenpräparation Lichtmikroskopie
Standard Fluoreszenzmikroskopie-theoretische Grundlagen
Messen von point spread function
Ermitteln der chromatischen Aberration
Theorie und Praxis: Konfokalmikroskopie
Bildbearbeitung

Literatur

J.Pawley, Handbook of Biological Confocal Microscopy, Springer, 2006
D.B.Murphy, Fundamentals of Light Microscopy and Electronic Imaging, Wiley, 2001 / 2009
E.M.Goldys, Flurescence Applications in Biotechnology and the Life Sciences, Wiley, 2009
Kevin F. Sullivan, Fluorescent Proteins (Methods in Cell Biology) , Academic Press, 2008
Molecular Biology of the Cell, Alberts, Garland Sciences,
Review series on „Imaging in Cell Biology“ in Nature Cell Biology Vol 5 (2003) Supplement
Review series on „Biological Imaging“ in Science Vol 300 (2003), 82-99
Eric C. Wait, Michael A. Reiche, Teng-Leong Chew: “Hypothesis-driven quantitative fluorescence microscopy – the importance of reverse-thinking in experimental design”, Journal of Cell Science 2020 133: jcs250027 doi: 10.1242/jcs.250027
Jonkman, J., Brown, C.M., Wright, G.D. et al. Guidance for quantitative confocal microscopy. Nat Protoc (2020). https://doi.org/10.1038/s41596-020-0307-7
https://www.ibiology.org/online-biology-courses/microscopy-series/

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

PhD-MB 2, WZB, MMB W-2, MMEI III, MMB IV.

Letzte Änderung: Di 06.12.2022 14:29