Universität Wien

301214 UE Toolkit für in silico Sequenzanalysen (2023W)

vormals UE IIIB

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT

Zusammenfassung

1 Zeiler , Moodle
2 Dammermann , Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").
An/Abmeldeinformationen sind bei der jeweiligen Gruppe verfügbar.

Gruppen

Gruppe 1

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 2.10.2023, 10.00 Uhr online
Termin: 13.- 17.11..2023 - 9.00 - 17.00 Uhr
VBC 5/EDV-Raum - am 14.11. im SR 6.505/Dr.Bohrgasse 9.1030 Wien.

Voraussetzung ist die VO Genexpression(Bachelor Biologie)
Siehe auch Studentenseite der Departments:
http://molekularebiologie.univie.ac.at/

  • Montag 02.10. 10:00 - 11:00 Digital
  • Montag 13.11. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 14.11. 09:00 - 17:00 BZB EDV-Raum CCR01, 6.Ebene 6.505, Dr.-Bohr-Gasse 9, 1030 Wien
  • Mittwoch 15.11. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 16.11. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 17.11. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Gruppe 2

max. 15 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch
Lernplattform: Moodle

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Vorbesprechung 2.10.2023, 10.00 Uhr online
Termin: 11.- 15.12.2023 - 9.00 -17. 00 Uhr

Voraussetzung ist die VO Genexpression(Bachelor Biologie)
Siehe auch Studentenseite der Departments: http://molekularebiologie.univie.ac.at/

  • Montag 02.10. 10:00 - 11:00 Digital (Vorbesprechung)
  • Montag 11.12. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Dienstag 12.12. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Mittwoch 13.12. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Donnerstag 14.12. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien
  • Freitag 15.12. 09:00 - 17:00 CCR03-Raum 1.113 Campus Vienna Biocenter, 1030 Wien

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Ziele:
Erwerben von Fähigkeiten, Datenbanken für Genom-, DNA-, RNA- und Protein-Sequenzen zu verwenden und diese Sequenzen für die grundlegenden Aufgaben der molekularbiologischen Forschung zu analysieren.
Inhalte:
Suche und Findung von Sequenzen; Sequenzvergleich und Analyse von Homologien; Identifikation von Proteindomänen mittels „multiple sequence alignment“; in silico Plasmidklonierung; Design von Genomeditierung mittels CRISPR/Cas9; Design von Primern für qPCR, PCR; Analyse von qPCR-Experimenten; Proteinstrukturen
Methoden:
Praktische Übung am Computer

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Aktive Teilnahme und Lösung von Aufgaben Versuche, schriftliches Protokoll und Abschlussprüfung.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Beurteilt wird: Aktive Mitarbeit, Protokoll, Abschlussprüfung
Gesamtbeurteilung: aktive Mitarbeit 25%, Protokoll 25%, Abschlussprüfung 50%
Jede der Teilleistungen muss positiv sein.

Prüfungsstoff

Inhalt der Übungseinheiten

Literatur

Unterlagen und Programm in Moodle; Originalliteratur auf den Web-Seiten der Datenbanken und Web-Services

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB II., MMB I-2, MMB II-2, MMB III-2, MMB W-2, MGE III-1, MGE III-2, MMEI III, MNEU V.

Letzte Änderung: Do 20.02.2025 00:20