Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301224 SE Bioinformatics for Microbial Metagenomics (2022W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
VOR-ORT
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 20 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

Blockveranstaltung

  • Montag 07.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 10.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Montag 14.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 17.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Montag 21.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 24.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Montag 28.11. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Donnerstag 01.12. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Montag 05.12. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1
  • Montag 12.12. 15:00 - 18:15 Seminarraum 1.6, Biologie Djerassiplatz 1, 1.011, Ebene 1

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

This course will focus on bioinformatic approaches in metagenomics for the analysis of mixed microbial communities (microbiomes). The aim of the course is to provide the student with the ability to perform metagenomic analyses and importantly be able to interpret these analyses in the wider biological context. Topics that will be covered include community profiling, genome reconstruction from mixed samples, comparative genomics, exploring the uncharacterised hidden microbial diversity in samples and phylogenetics. The course will offer practical exercises as well as a group project to support the lectures and discussions in class.

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Assessment will be based on a group project and overall examination.
Participants must achieve at least 50 pts. by the end of the course.
Grading:
< 50.0: 5
< 62.5: 4
< 75.0: 3
< 87.5: 2
else: 1

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

There are no strict minimum requirements. But students should have experience in Unix/Linux. A basic understanding of Microbiology is recommended and knowledge of microbial genomics would be advantageous.

Prüfungsstoff

Presentation of group project and examination of content presented in the course.

Literatur

Will be provided during the lecture on the elearning platform.

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

MMB W-2, MMB W-3, MMEI II-2.2; MMEI III

Letzte Änderung: Mo 23.01.2023 14:09