Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301590 VU Grundlagen der Bioinformatik (2024W)

5.00 ECTS (3.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
Moodle

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Details

max. 130 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine (iCal) - nächster Termin ist mit N markiert

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  • Montag 07.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 14.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 21.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 28.10. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 04.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 11.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 18.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 25.11. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 02.12. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 09.12. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 16.12. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 13.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 20.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9
  • Montag 27.01. 08:00 - 13:00 Hörsaal 31 Hauptgebäude, 1.Stock, Stiege 9

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Einführung in die grundlegenden Algorithmen der Bioinformatik mit
Schwerpunkt auf Sequenzanalyse.
Sequenzähnlichkeit; Dynamische Programmierung; Alignmentalgorithmen wie
Needleman-Wunsch, Smith-Waterman und Gotoh, BLAST und FASTA;
Multiple Sequenzalignments; Clustering und
Phylogenierekonstruktion; RNA Sekundärstrukturen.
Lernbehelf: Vorlesungsunterlagen
Beurteilung: Hausübungen und Prüfungen

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Hausübungen und 2 schriftliche Prüfungen
Erlaubte Hilfsmittel bei Prüfungen: Taschenrechner

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verständnis grundlegender Methoden der Sequenzanalyse, sowie
ausgewählter Algorithmen und Methoden aus dem Bereich der Phylogenierekonstruktion und Strukturvorhersage.
Beurteilungsmaßstab: gewichtetes Mittel von Noten auf Hausübungen und Prüfungen.

Prüfungsstoff

Inhalt der Vorlesungen und Folien

Literatur

Siehe moodle

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

BMB 7, BMG 7

Letzte Änderung: Fr 04.10.2024 00:02