Universität Wien
Achtung! Das Lehrangebot ist noch nicht vollständig und wird bis Semesterbeginn laufend ergänzt.

301901 VO+UE Introduction into 3D cryo electron microscopy (2022S)

3.00 ECTS (2.00 SWS), SPL 30 - Biologie
Prüfungsimmanente Lehrveranstaltung
GEMISCHT
Moodle

An/Abmeldung

Hinweis: Ihr Anmeldezeitpunkt innerhalb der Frist hat keine Auswirkungen auf die Platzvergabe (kein "first come, first served").

Details

max. 25 Teilnehmer*innen
Sprache: Englisch

Lehrende

Termine

Dates: Tuesday 16:00-17:30
15.03 Lecture 1 Introduction and history of cryo EM (Plaschka)
22.03 Lecture 2 Sample preparation (Plaschka)
29.03 Lecture 3 Sample preparation practical (Heuser)
05.04 Lecture 4 Math and Physics Background (Juffmann)
12.04 Easter holiday
19.04 Easter holiday
26.04 Lecture 5 Anatomy of the electron microscope (Juffmann)
03.05 Lecture 6 Image formation (Juffmann)
10.05 Lecture 7 Imaging practical (Heuser)
17.05 Lecture 8 Image processing single particle (Haselbach)
24.05 Lecture 9 Image processing single particle practical (Haselbach)
31.05 Lecture 10 Image processing Tomography (Haselbach)
07.06 Pentacoste holiday.
14.06 Lecture 11 Image processing Tomography practical (Heuser)
21.06 Lecture 12 Volume Interpretation (Falk)
28.06 Lecture 13 Future Outlook (all lecturers)

Information

Ziele, Inhalte und Methode der Lehrveranstaltung

Mathematical Background Fourier Theory for 3D EM Correlation and Convolution Information theory for 3D EM Optics of the Transmission electron microscope The electron source The condenser system The objective and image generation within an electron microscope Electron detection Sample preparation Image processing Single particle 2D analysis Single particle 3D generation Single particle refinement and validation Tomographic processing Modern conceptsPracticals/Tutorials: Negative staining EM Cryo EM Tomographic acquisition Single particle image processing Tomographic image processing

Art der Leistungskontrolle und erlaubte Hilfsmittel

Die Beurteilung basiert auf folgenden Teilleistungen: Aktive Teilnahme und Ergebnis der Versuche, theoretisches Wissen in Form einer Abschlussprüfung.

Mindestanforderungen und Beurteilungsmaßstab

Verpflichtende AnwesenheitGrundverstaendis der Konzepte soll erworben werdenAktive Teilnahme und Ergebnis der Versuche, Theoretisches Wissen (Abschlussprüfung);(Die prozentuelle Aufteilung der Teilleistungen wird vom Kursleiter bekanntgegeben, jede der Teilleistungen muss positiv sein.)

Prüfungsstoff

Inhalte der Lehrveranstaltungseinheiten

Literatur

Zuordnung im Vorlesungsverzeichnis

PhD (SPL 56), WZB, MMB W-2, MMEI III

Letzte Änderung: So 06.03.2022 11:29