859210 VO+UE Phylogenetische Analyse: Biometrie III (2004S)

ECTS Punkte: 3
Aufbauend auf Biometrie I, werden die theoretischen Grundlagen der Baumkonstruktion aus biologischen Daten vertieft. Merkmalskodierung und die Verfahren der Maximum Parsimony, Distanzmethoden, Maximum Likelihood und Spektralanalyse werden detailliert behandelt, ebenso wie deren Anwendungsmöglichkeiten für morphologische und diverse molekulare Daten und deren Kombination. Wesentlicher Punkt ist die praktische Umsetzung und Anwendung dieser Methoden auf reale Daten mit gängigen Computerprogrammen (z.B. PHYLIP, PAUP). Deren Optionen und Grenzen sowie die Input-Formate werden vorgestellt und getestet, die Interpretation des Output erklärt. Nach Bedarf können auch Alignment-Programme für molekulare Sequenzdaten behandelt werden. Ein wichtiger Aspekt ist die Beurteilung der Datenqualität und der Robustheit phylogenetischer Signale und der daraus gezogenen Schlüsse. In individuellen Mini-Projekten werden die erlernten Methoden angewandt, in publikations-ähnlicher Form schriftlich, und in einem Kurzvortrag mündlich präsentiert. Die Bewältigung dieser Aufgabe dient als Beurteilungsgrundlage.
Lehrziele sind die Fähigkeit zur selbstständigen phylogenetischen Analyse und zur kritischen Beurteilung fremder Analysen.